Page 177 -
P. 177
โครงการหนังสืออิเล็กทรอนิกส์ด้านการเกษตร เฉลิมพระเกียรติพระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัว
170 พันธุศาสตร์ประชากร
สำาหรับการปรับปรุงพันธุ์
ส�าหรับเครื่องหมายโมเลกุลที่แสดงความแตกต่างจากตัวอย่างข้างต้น พบจ�านวน 3 เครื่องหมาย
โมเลกุลที่มีค่าความถี่ของอัลลีลน้อยกว่า 0.99 คือ locus 1, 3 และ 5 ส่วน Locus 2 และ 4 มีค่าความถี่
ของอัลลีลเท่ากับ 1 เป็น monomorphic marker
52 52 พันธุศาสตร์ประชากรกับการปรับปรุงพันธุ์ พันธุศาสตร์ป ระชากรกับการปรับปรุงพันธุ์ 3
สัดส่วนของการเกิด polymorphic มีค่าเท่ากับ x 100 = 60 เปอร์เซ็นต์
5
จากข้อมูลภาพก�าหนดให้มีจ�านวนของต้นที่ไม่มี heterozygous, มี heterozygous 1 locus
เมื่อมีการผสมพันธุ์กันอย่างสุ่มในประชากร จะมีความถี่ของจีโนไทป์ที่เกิดขึ้นดังนี้ เมื่อมีการผสมพันธุ์กันอย่างสุ่มในประชากร จะมีความถี่ของจีโนไทป์ที่เกิดขึ้นดังนี้
52 52 และมี heterozygous 2 loci 21, 12 และ 7 ต้น ตามล�าดับ จะได้ค�านวณ H = [21(0/5) + 12(1/5) +
พันธุศาสตร์ประชากรกับการปรับปรุงพันธุ์ พันธุศาสตร์ประชากรกับการปรับปรุงพันธุ์
O
พ่อ พ่อ 7(2/5)] = 0.133 . . . . . .
. .
เมื่อมีการผสมพันธุ์กันอย่างสุ่มในประชากร จะมีความถี่ของจีโนไทป์ที่เกิดขึ้นดังนี้ เมื่อมีการผสมพันธุ์กันอย่างสุ่มในประชากร จะมีความถี่ของจีโนไทป์ที่เกิดขึ้นดังนี้
แม่ แม่
ส่วนค่า intralocus gene diversity (h) มีค่าของแต่ละ marker ดังนี้ M1 = 0.47 M2= 0.46
j
. . 0.1678AABB 0.1678AABB 0.0944AABb 0.0944AABb 0.0944AaBB 0.0944AaBB 0.0531AaBb 0.0531AaBb
และ M3 = 0.41 ตามล�าดับ ส่วนค่า H มีค่าเท่ากับ (0.47 + 0.46 + 0.41)/5 = 0.27
พ่อ พ่อ 0.0944AABb 0.0944AABb ͲǤͲͷ͵ͳAAbb ͲǤͲͷ͵ͳAAbb i 0.0531AaBb 0.0531AaBb 0.0299Aabb 0.0299Aabb
. .
. . . 2. กำรหำควำมหลำกหลำยทำงพันธุกรรมระหว่ำงประชำกร (interpopulation genetic
0.0531AaBb
.
0.0944AaBB .
0.0531aaBB
. .
. .
0.0299aaBb 0.0299aaBb
0.0531aaBB
0.0531AaBb
0.0944AaBB
.
แม่ แม่
. . 0.0531AaBb 0.0531AaBb 0.0299Aabb 0.0299Aabb 0.0299aaBb 0.0299aaBb 0.0168aabb 0.0168aabb
. . 0.1678AABB 0.167 diversity) 0.0944AABb 8AABB 0.0944AABb 0.0944AaBB 0.0944AaBB 0.0531AaBb 0.0531AaBb
0.0299Aabb 0.0299Aabb
ͲǤͲͷ͵ͳAAbb ͲǤͲͷ͵ͳAAbb
. . 0.0944AABb 0.0944AABb (1) กำรวัดควำมแตกต่ำงระหว่ำงประชำกรด้วยยีน 1 ต�ำแหน่ง (g )
0.0531AaBb 0.0531AaBb
0.1678AABB 0.1887 AABb 0.0531AAbb0.1678AABB 0.1887 AABb 0.0531AAbb
. . 0.0944AaBB 0.0944AaBB 0.0531AaBb 0.0531AaBb 0.0531aaBB 0.0531aaBB 0.0299aaBb 0.0299aaBb ST
ความถี่ของจีโนไทป์ในรุ่นลูก ความถี่ของจีโนไทป์ในรุ่นลูก = = [0.1887AaBB0.1887AaBB 0.2123AaBb0.2123AaBb 0.0597Aabb]
h
0.0597Aabb]
[
0.0299aaBb 0.0299aaBb
0.0168aabb 0.
. . 0.0531AaBb 0.0531AaBb สูตรที่ใช้ในการค�านวณ g = 1 - s0168aabb
0.0299Aabb 0.0299Aabb
h
ST
0.0531aaBB0.0531aaBB 0.0597 aaBb0.0597 aaBb 0.0168aabb0.0168aabb
T
ก�าหนดให้
การทดสอบประชากรที่อยู่ในสภาวะสมดุล การทดสอบประชากรที่อยู่ในสภาวะสมดุล
0.1678AABB 0.1887 AABb 0.0531AAbb0.1678AABB 0.1887 AABb 0.0531AAbb
ความถี่ของจีโนไทป์ในรุ่นลูก ความถี่ของจีโนไทป์ในรุ่นลูก [0.1887AaBB ความหลากหลายในประชากร (population diversity)
h
0.0597Aabb]
0.0597Aabb]
=
=
= 0.2123AaBb0.2123AaBb
[0.1887AaBB
S
0.0597 aaBb0.0597 aaBb
0.0531aaBB0.0531aaBB ̃ n 0.0168aabb0.0168aabb 2
2
นิยมใช้การทดสอบนิยมใช้การทดสอบค่าด้วยวิธีไคสแควร์ (Chi-square) 2 n n (O (O h ) ) ]
× [1 - x - ] ] จากสูตร
o
=
1 2
2 i −E ii −E i
s
̃
ค่าด้วยวิธีไคสแควร์ (Chi-square) จากสูตร = ∑ = ∑ [ [ E i E
̃ n-1
i=1i=1
i
การทดสอบประชากรที่อยู่ในสภาวะสมดุล การทดสอบประชากรที่อยู่ในสภาวะสมดุล j ij 2n i
ก าหนดให้ ก าหนดให้ h = ความหลากหลายทั้งหมด (total diversity)
T
1
1 - [ x ] + - ]
=
นิยมใช้การทดสอบค่าด้วยวิธีไคสแควร์ (Chi-square) จากสูตร = ∑= ∑ (O i −E )(O h 2 ] ) 2 h o
นิยมใช้การทดสอบค่าด้วยวิธีไคสแควร์
(Chi-square) จากสูตร
s
2
n
2
n
2 i i −E i
s
̃
[
[
=
= ค่าไคสแควร์ ค่าไคสแควร์ i=1 i=1 ns ̃ 2ns
2 2
E i
ij E i
n
i =
i = ค่าที่ได้จากการทดลองของลักษณะที่ i ค่าที่ได้จากการทดลองของลักษณะที่ i
ก าหนดให้ ก าหนดให้ O O ̃ = Harmonic average of population size
i =
i = ค่าที่คาดหมายของลักษณะที่ i ค่าที่คาดหมายของลักษณะที่ i
E E s = จ�านวนประชากรที่ศึกษา
= ค่าไคสแควร์ ค่าไคสแควร์
= h = Average observed diversity
2
2
n n
=
o
i =
O O = จ านวนลักษณะที่ท าการทดสอบ จ านวนลักษณะที่ท าการทดสอบ
i = ค่าที่ได้จากการทดลองของลักษณะที่ i ค่าที่ได้จากการทดลองของลักษณะที่ i
x
และเมื่อท าการค านวณไคสแควร์แล้วเและเมื่อท าการค านวณไคสแควร์แล้ = ความถี่ของอัลลีล i ในประชากร j
ijปรียบเทียบกับตารางไคสแควร์ พบว่า ถ้าประชากรมีค่าไคสวเปรียบเทียบกับตารางไคสแควร์ พบว่า ถ้าประชากรมีค่าไคส
i =
i = ค่าที่คาดหมายของลักษณะที่ i ค่าที่คาดหมายของลักษณะที่ i
E E g จะมีค่าอยู่ระหว่าง 0 - 1
แควร์ที่น้อยกว่าค่าไคสแควร์ที่เปิดจากตารางแปลว่า ประชากรจะอยู่ในสมดุล แควร์ที่น้อยกว่าค่าไคสแควร์ที่เปิดจากตารางแปลว่า ประชากรจะอยู่ในสมดุล
ST
n = จ านวนลักษณะที่ท าการทดสอบ จ านวนลักษณะที่ท าการทดสอบ
n
=
จากตัวอย่างในประชากรที่มียีนควบคุม 1 ยีน ประกอบด้วยลักษณะที่ปรากฏดอกสีแดง (AA) 20 ต้น จากตัวอย่างในประชากรที่มียีนควบคุม 1 ยีน ประกอบด้วยลักษณะที่ปรากฏดอกสีแดง (AA) 20 ต้น
และเมื่อท าการค านวณไคสแควร์แล้วเปรียบเทียบกับตารางไคสแควร์ พบว่า ถ้าประชากรมีค่าไคสและเมื่อท าการค านวณไคสแควร์แล้วเปรียบเทียบกับตารางไคสแควร์ พบว่า ถ้าประชากรมีค่าไคส
ก�าหนดให้ ประชากรที่ท�าการศึกษามี 3 ประชากร แต่ละประชากรประกอบด้วย 100 ต้น ท�าการ
ดอกสีชมพู (Aa) 70 ต้น และดอกสีขาว (aa) 110 ต้น ท าการตรวจสอบความถี่ของจีโนไทป์ว่าเป็นไปตามดอกสีชมพู (Aa) 70 ต้น และดอกสีขาว (aa) 110 ต้น ท าการตรวจสอบความถี่ของจีโนไทป์ว่าเป็นไปตาม
แควร์ที่น้อยกว่าค่าไคสแควร์ที่เปิดจากตารางแปลว่า ประชากรจะอยู่ในสมดุล แควร์ที่น้อยกว่าค่าไคสแควร์ที่เปิดจากตารางแปลว่า ประชากรจะอยู่ในสมดุล
หาความแตกต่างระหว่างประชากรได้ดังตารางจากค�านวณด้วยสูตรข้างบน
ความถี่ของกฎฮาร์ดี-ไวน์เบิร์กหรือไม่ ความถี่ของกฎฮาร์ดี-ไวน์เบิร์กหรือไม่
จากตัวอย่างในประชากรที่มียีนควบคุม 1 ยีน ประกอบด้วยลักษณะที่ปรากฏดอกสีแดง (AA) 20 ต้น จากตัวอย่างในประชากรที่มียีนควบคุม 1 ยีน ประกอบด้วยลักษณะที่ปรากฏดอกสีแดง (AA) 20 ต้น
ดอกสีชมพู (Aa) 70 ต้น และดอกสีขาว (aa) 110 ต้น ท าการตรวจสอบความถี่ขดอกสีชมพู (Aa) ก าหนดให้ p คือ ความถี่ของยีน A และ q คือความถี่ของยีน a
ก าหนดให้ p คือ ความถี่ของยีน A และ q คือความถี่ของยีน a องจีโนไทป์ว่าเป็นไปตาม 70 ต้น และดอกสีขาว (aa) 110 ต้น ท าการตรวจสอบความถี่ของจีโนไทป์ว่าเป็นไปตาม
ความถี่ของกฎฮาร์ดี-ไวน์เบิร์กหรือไม่ ความถี่ของกฎฮาร์ดี-ไวน์เบิร์กหรือไม่ 1 1
1 1
20+ (70)20+ (70)
110+ (70)110+ (70)
∴ ความถี่ของยีน A = ∴ ความถี่ของยีน A = 2 2 = 0.275 และ ความถี่ของยีน a = = 0.275 และ ความถี่ของยีน a = 2 2 = 0.725 = 0.725
ก าหนดให้ p คือ ความถี่ของยีน A และ q คือความถี่ของยีน a ก าหนดให้ p คือ ความถี่ของยีน A และ q คือความถี่ของยีน a 200200
200200
จากการค านวณจ านวนต้นที่มีจีโนไทป์ตามกฎฮาร์ดี-ไวน์เบิร์ก ซึ่งค านวณความถี่ของยีนได้ดังนี้ จากการค านวณจ านวนต้นที่มีจีโนไทป์ตามกฎฮาร์ดี-ไวน์เบิร์ก ซึ่งค านวณความถี่ของยีนได้ดังนี้
1 1 1 1
20+ (70)20+ (70)
110+ (70)110+ (70)
∴ ความถี่ของยีน A = ∴ ความถี่ของยีน A = 2 2 = 0.275 และ ความถี่ของยีน a = = 0.275 และ ความถี่ของยีน a = 2 2 = 0.725 = 0.725
จ านวนต้นที่มีจีโนไทป
200 200์ AA ตามค่าที่คาดหมาย = p × 200
2 2
2 2
200
จ านวนต้นที่มีจีโนไทป์ AA ตามค่าที่คาดหมาย = p × 200 200 = (0.275) × 200 = (0.275) × 200
จากการค านวณจ านวนต้นที่มีจีโนไทป์ตามกฎฮาร์ดี-ไวน์เบิร์ก ซึ่งค านวณความถี่ของยีนได้ดังนี้ จากการค านวณจ านวนต้นที่มีจีโนไทป์ตามกฎฮาร์ดี-ไวน์เบิร์ก ซึ่งค านวณความถี่ของยีนได้ดังนี้
จ านวนต้นที่มีจีโนไทป์ AA ตามค่าที่คาดหมาย
จ านวนต้นที่มีจีโนไทป์ AA ตามค่าที่คาดหมาย = p × 200 = p × 200 = (0.275) × 200 = (0.275) × 200
2
2
2
2
